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对这一设想，中国领导人给予了充分肯定和支持，并为此做出重要批示。经过多方论证和调查，由科技部、开展改革委员会、教育部、卫生部、中国科研实验室、国家自然科学基金会、北京市政府、中国医学科学院等8个部委为主体组成理事会，共同管理北京科学生命购宝钱包 的筹建和运行工作。北京市政府和国家科技部负责具体实施和给予主要的资金。每届理事会任期3年。

购宝钱包 实行理事会领导下的所长负责制，理事会是购宝钱包 的决策组织。第一任科学指导委员会由理事会聘任国内外著名科学家，组成科学指导委员会。科学指导委员会是学术咨询组织，其主要任务是对购宝钱包 所长进行聘任前的学术评估，提出推荐意见；对购宝钱包 的研究工作做出评估并提出建议。每届科学指导委员会的任期为3年。

购宝钱包 所长的聘任实行国际公开招聘，理事会发布招聘公告，并由理事会聘请的科学指导委员会进行评估、推荐后，由理事会聘任。科技部批准所长任职资格。所长必须在科学生命领域有世界领先水平的科研成果，且有很高的学术造诣和国际声誉。所长任期为5年，可以连任。2003年4月，理事会聘任美国得克萨斯大学西南医学中心的生物化学和细胞生物学家、美国科学院院士王晓东博士，和耶鲁大学植物分子生物学家邓兴旺博士为北京科学生命购宝钱包 第一任共同所长。2009年10月，理事会聘任王晓东博士为北京科学生命购宝钱包 第二任所长。

实验室和科研辅助中心构成购宝钱包 科学研究工作主体，其中实验室为基本单位。实验室主任引用国际公开招聘的制度，经过所长聘请的评选委员会进行严格评估筛选后，由购宝钱包 所长批准。实验室主任聘任期为5年，实验室主任的工作将由科学指导委员会根据其学术水平和科研成果进行评审，同时所长结合其研究工作、对购宝钱包 的综合贡献和未来开展的需要来决定其是否进入下一期聘任。辅助中心主任由购宝钱包 所长指派或聘任。

北京科学生命购宝钱包 英文名称是“National Institute of Biological Sciences, Beijing（国家科学生命购宝钱包 ，北京）”。

北京科学生命购宝钱包 位于北京市中关村科学生命园科学园路7号。